Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM53CQ9NYF3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FAM53CQ9NYF3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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