Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms