Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJB4Q9NTQ9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms