Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH2B1Q9NRF2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms