Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IL1RAPQ9NPH3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IL1RAPQ9NPH3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms