Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPF2Q9HAU5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms