Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC52A2Q9HAB3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC52A2Q9HAB3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms