Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MIXL1Q9H2W2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MIXL1Q9H2W2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms