Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LHX5Q9H2C1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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