Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCL11BQ9C0K0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCL11BQ9C0K0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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