Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL4Q9C0H6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms