Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRP1Q9C000 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP1Q9C000 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms