Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCGF6Q9BYE7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCGF6Q9BYE7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms