Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK3Q9BYB0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHANK3Q9BYB0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms