Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
REPIN1Q9BWE0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
REPIN1Q9BWE0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms