Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTA3Q9BTC8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTA3Q9BTC8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms