Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTKNQ9BST9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTKNQ9BST9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms