Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PKNOX2Q96KN3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms