Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SCMH1Q96GD3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms