Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C18orf8Q96DM3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms