Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC47Q96A33 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC47Q96A33 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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