Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKL1Q969V6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms