Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SRSF12Q8WXF0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF12Q8WXF0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms