Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH3RF3Q8TEJ3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF3Q8TEJ3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms