Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCL2Q8N4E4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms