Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U1

Putative uncharacterized protein LOC400692, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N3U1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q8N3U1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Q8N3U1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q8N3U1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q8N3U1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q8N3U1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q8N3U1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q8N3U1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8N3U1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8N3U1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8N3U1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8N3U1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8N3U1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8N3U1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8N3U1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8N3U1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8N3U1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms