Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q71RC1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q71RC1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q71RC1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms