Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FGD6Q6ZV73 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FGD6Q6ZV73 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms