Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBR3Q6ZT12 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms