Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CASP12Q6UXS9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 394.7 ms