Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF544Q6NX49 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF544Q6NX49 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms