Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATG16L1Q676U5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms