Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SAPCD1Q5SSQ6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms