Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HSD17B12Q53GQ0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HSD17B12Q53GQ0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms