Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CEP55Q53EZ4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CEP55Q53EZ4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms