Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SP6Q3SY56 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SP6Q3SY56 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms