Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP13-3Q3SY46 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP13-3Q3SY46 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms