Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT24Q2M2I5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT24Q2M2I5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms