Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC27Q2M243 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC27Q2M243 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms