Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SKIDA1Q1XH10 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKIDA1Q1XH10 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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