Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KNOP1Q1ED39 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KNOP1Q1ED39 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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