Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 CU638689.4-208ENST00000623324 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 CU634019.6-203ENST00000624728 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
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FOXD1Q16676 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
FOXD1Q16676 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
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FOXD1Q16676 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
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FOXD1Q16676 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
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FOXD1Q16676 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
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FOXD1Q16676 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AL121929.2-201ENST00000609691 1432 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXD1Q16676 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
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