Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP6AP1Q15904 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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