Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
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PTPRKQ15262 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
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PTPRKQ15262 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
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PTPRKQ15262 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
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PTPRKQ15262 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
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PTPRKQ15262 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
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PTPRKQ15262 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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PTPRKQ15262 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPRKQ15262 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRKQ15262 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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