Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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