Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB39AQ14964 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms