Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BECN1Q14457 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN1Q14457 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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