Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERV3-1Q14264 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms