Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFR3AQ14156 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms