Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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